В состав института входят три кафедры, две из которых в настоящее время являются выпускающими:
Кафедра "Общая и прикладная физика" (ОиПФ)
Кафедра "Физика и прикладная математика" (ФиПМ)
- бакалавриат "Прикладная математика и информатика"
- бакалавриат "Математическое обеспечение и администрирование информационных систем"
- бакалавриат "Фундаментальные информатика и информационные технологии"
- бакалавриат "Лазерная техника и лазерные технологии"
- бакалавриат "Нанотехнологии и микросистемная техника"
- магистратура "Прикладная математика и информатика"
- магистратура "Лазерная техника и лазерные технологии"
- магистратура "Нанотехнологии и микросистемная техника"
Кафедра "Функциональный анализ и его приложения" (ФАиП)
- бакалавриат "Математика и компьютерные науки" (по ФГОС)
- магистратура "Математика и компьютерные науки" (по ФГОС)